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documentation:vocabulary:mapping

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 This is possible due to the following reasons:  ​ This is possible due to the following reasons:  ​
-  * Vague formulation of a Source Concept +| source concept code                                                     | source concept name                                                     | relationship ID  | standard concept ID  | standard concept code  | standard concept name                   | 
-  ​Source Concept excessive granularity +^  1. Vague formulation of a Source Concept ​                                                                                                                                                                                                                |||||| 
-  ​Classification difference between Source and Standard Vocabularies+| M99.9                                                                   | Biomechanical lesion, unspecified ​                                      | Maps to          | 4244662 ​             | 928000 ​                | Disorder of musculoskeletal system ​     | 
 +| A28.9                                                                   | Zoonotic bacterial disease, unspecified ​                                | Maps to          | 432545 ​              | 87628006 ​              | Bacterial infectious disease ​           | 
 + 2. Source Concept excessive granularity ​                                                                                                                                                                                                                 ​|||||| 
 +| B33.4                                                                   | Hantavirus (cardio-)pulmonary syndrome [HPS] [HCPS] ​                    | Maps to          | 441784 ​              | 359761005 ​             | Disease due to Hantavirus ​              | 
 +| I12.9                                                                   | Hypertensive renal disease without renal failure ​                       | Maps to          | 201313 ​              | 38481006 ​              | Hypertensive renal disease ​             | 
 +| S06.4x9 ​                                                                | Epidural hemorrhage with loss of consciousness of unspecified duration ​ | Maps to          | 4306943 ​             | 82999001 ​              | Epidural hemorrhage ​                    | 
 +| :::                                                                     | :::                                                                     | Maps to          | 372448 ​              | 419045004 ​             | Loss of consciousness ​                  | 
 +| S35.415 ​                                                                | Laceration of left renal vein                                           | Maps to          | 4124868 ​             | 234084003 ​             | Venous laceration ​                      | 
 +| :::                                                                     | :::                                                                     | Maps to          | 195125 ​              | 5753006 ​               | Injury of renal vein                    | 
 +^  3. Classification difference between Source and Standard Vocabularies ​                                                                                                                                                                                   ​|||||| 
 +| I48                                                                     | Atrial fibrillation and flutter ​                                        | Maps to          | 4068155 ​             | 17366009 ​              | Atrial arrhythmia ​                      | 
 +| G06.0                                                                   | Intracranial abscess and granuloma ​                                     | Maps to          | 4181187 ​             | 363176004 ​             | Inflammatory disorder of head           | 
 +| J38.0                                                                   | Paralysis of vocal cords and larynx ​                                    | Maps to          | 4233244 ​             | 89927005 ​              | Paralysis of larynx ​                    | 
 +| U82.1                                                                   | Resistance to methicillin ​                                              | Maps to          | 37017452 ​            | 713728002 ​             | Drug resistance to antibacterial agent  | 
  
 **Other possible issues that one could encounter:​** ​ **Other possible issues that one could encounter:​** ​
Line 102: Line 116:
   * Code irrelevant to the patient, for example, ICD-9-CM V65 “Other persons seeking consultation”   * Code irrelevant to the patient, for example, ICD-9-CM V65 “Other persons seeking consultation”
   * Source code is ill-defined,​ for example, ICD-9-CM 799 “Other ill-defined and unknown causes of morbidity and mortality”   * Source code is ill-defined,​ for example, ICD-9-CM 799 “Other ill-defined and unknown causes of morbidity and mortality”
- 
-=== CONDITION MAPPING ALGORITHM === 
-{{ :​documentation:​vocabulary:​mapping_of_concepts_2_1_5_.png?​600 |}} 
  
 === RULES FOR CONDITION MAPPING === === RULES FOR CONDITION MAPPING ===
Line 157: Line 168:
 **Conditions resulting from the use of Devices.** **Conditions resulting from the use of Devices.**
 Adverse or other outcomes of the exposure to a device are mapped to 473023007 "​Complication associated with device and with another "Maps to value" relationship to the device itself, if possible. For example, ICD10 Y73.0 concept_id 45590664 "​Gastroenterology and urology devices associated with adverse incidents, diagnostic and monitoring devices"​ has a "Maps to value" link to 45767866 "​Gastro-urological device"​. Adverse or other outcomes of the exposure to a device are mapped to 473023007 "​Complication associated with device and with another "Maps to value" relationship to the device itself, if possible. For example, ICD10 Y73.0 concept_id 45590664 "​Gastroenterology and urology devices associated with adverse incidents, diagnostic and monitoring devices"​ has a "Maps to value" link to 45767866 "​Gastro-urological device"​.
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 +=== CONDITION MAPPING ALGORITHM ===
 +{{ :​documentation:​vocabulary:​mapping_of_concepts_2_1_5_.png?​600 |}}
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documentation/vocabulary/mapping.txt · Last modified: 2019/12/16 10:43 by ptalapova